Samedi 08 Août 2020

GBIF

Le secrétariat du GBIF recherche un entrepreneur pour développer une application frontale basée sur React. Cette application multilingue basée sur des formulaires offrira aux éditeurs du monde entier la possibilité de gérer du contenu accessible via GBIF.org.

 

Compétences demandées :

  • Expérience de React JS et de l'environnement de construction SPA associé
  • Aisance avec les API RESTful
  • Connaissance des mécanismes d'autorisation modernes, tels que JSON Web Token
  • Connaissance des bibliothèques frontales Material UI ou Ant Design
  • Aisance avec la construction de SPA traduisibles
  • Connaissance des frameworks de test pour la validation des entrées de formulaire
  • Maîtrise de GitHub

 

Contexte

Dans le cadre de son infrastructure principale, le GBIF gère une base de données d'entités : organisations, personnes et jeux de données, toutes consultables via une interface RESTful (JSON) authentifiée. Aujourd'hui, une console Web basée sur AngularJS offre aux éditeurs internes la possibilité de gérer le contenu.

 

Les récentes extensions de l'API avec de nouveaux types de contenu, le désir d'ouvrir l'accès à l'édition aux utilisateurs externes et la nécessité de traiter une pile logicielle vieillissante ont amenés le secrétariat à rechercher une nouvelle solution. Le GBIF a développé une preuve de concept basée sur React et recherche un fournisseur pour les aider à mettre ce concept en production.

 

Les détails de la spécification du projet sont disponible ici

 

Approche

Le secrétariat prévoit une première session de contrôle sur site dans leur locaux, à Copenhague pour présenter le système existant et les exigences des fonctionnalités recherchées. Les travaux ultérieurs peuvent être entrepris à distance, en utilisant GitHub comme base de collaboration et avec des visites sur site uniquement si nécessaire.

 

Tout le code sera chargé dans le référentiel GitHub GBIF et publié sous une licence open source Apache 2.0.

 

Le GBIF souhaite la bienvenue aux manifestations d’intérêt pour entreprendre ce travail le plus tôt possible. Si vous êtes intéressé, veuillez envoyer un e-mail à Tim Robertson, responsable informatique du GBIF, avec:

  • Deux exemples ou plus montrant votre travail basé sur React
  • Une indication de votre taux journalier ou de votre préférence escompté (à discuter) lors d'une livraison à prix fixe
  • des informations sur votre disponibilité

 

Cet appel restera ouvert jusqu'à la nomination d'un contractant.

 

Plus d'information (en anglais) ici

 

Poulpe commun (Octopus vulgaris), au large de la côte sud-ouest de Bonaire. Photo 2018 de Dan Bender via des observations iNaturalist de recherche, autorisées sous CC BY-NC-SA 4.0.

Le secrétariat du GBIF, situé à Copenhague, recherche un développeur de logiciels pour travailler dans une petite équipe responsable du portail GBIF.org. Ce rôle se concentrera sur les services principaux et sur tous les aspects liés à l’API GBIF et aux services de données. Le poste est un poste à temps plein situé à Copenhague pour une période de 3 ans.

 

Compétences requises et expérience

  • Compétences de développement en Java 8 (ou autres langages JVM) ; modèles de conception logicielle, environnement multithread, gestion de la JVM et de la mémoire, structures de données et collections
  • Connaissance des banques de données; bases de données relationnelles (SQL)
  • Solide connaissance des services RESTful utilisant les formats XML et JSON
  • Compétences professionnelles en matière d'ingénierie logicielle: gestion des versions (versions maven, code de version forte), refactoring, normes de codage, intégration continue, tests d'unité / d'intégration, déploiement de logiciel et documentation
  • Maîtrise de l'utilisation du système d'exploitation Linux
  • Capacité à travailler dans un environnement anglophone
  • Compétences professionnelles pour donner et recevoir des commentaires sur le code
  • La capacité de travailler de manière autonome et en équipe

 

Compétences souhaitées

  • Les cadres Java Microservice; exemple: Dropwizard, Spring Boot, Vert.x,
  • Expérience en automatisation (Jenkins, Ansible, Chef, Marionnette, etc.)
  • Moteurs de recherche (Solr Cloud, Elasticsearch).
  • Expérience avec des solutions de surveillance (Nagios, Ganglia, Zabbix, Cactus, Graphite, ELK, etc.)
  • Connaissance de l'écosystème Hadoop (HDFS, Solr, HBase, Spark, Beam, Zookeeper)
  • Expérience de travail et de contribution à des projets open source

Avantages à travailler au GBIF

  • Une bonne ambiance d'équipe et un environnement de travail dynamique
  • L'opportunité d'apprendre et d'utiliser les technologies Big Data de pointe de l'écosystème Hadoop (HBase, Hive, Oozie, Solr Cloud, Spark, Beam)
  • La possibilité de travailler publiquement sur des projets open source, avec une implication directe dans la communauté des utilisateurs
  • Un package de rémunération compétitif
  • Un ordinateur portable puissant (Apple ou similaire) pour le développement
  • Plus important encore, le GBIF offre la possibilité de contribuer de manière significative à un effort international visant à créer et à gérer la plateforme Web mondiale pour les données ouvertes sur la biodiversité.

 

Il s’agit d’une opportunité passionnante pour les personnes concernées de développer leur expérience pour une organisation internationale dans un environnement scientifique et technologique en informatique de la biodiversité pour le développement durable. Si vous répondez à ces exigences et êtes en mesure de commencer dès que possible, nous espérons avoir de vos nouvelles.

 

Rémunération

Les salaires du GBIF sont compétitifs et sont exonérés de l'impôt sur le revenu danois. Le candidat sélectionné devrait vivre au Danemark et un programme de réinstallation est disponible pour le personnel recruté sur le plan international.

 

Procédure de candidature et délai

Les candidatures au poste doivent inclure une lettre mentionnant votre expérience et vos qualifications pour le poste, votre curriculum vitae et votre nom d'utilisateur GitHub. Elles doivent être soumises en anglais par courrier électronique à dev-job1-2018@gbif.org avant le 15 décembre 2018. Veuillez indiquer dans l'application où vous avez vu cette annonce. Les demandes concernant le poste peuvent être adressées à Federico Mendez, développeur logiciel principal, à fmendez@gbif.org, ou à la responsable des ressources humaines, Susanne Sheldon, à slsheldon@gbif.org.

 

Les entretiens pour le poste devraient avoir lieu à partir du début janvier 2019.

 

Offre d'emploi en version PDF

 

Plus d'informations ici

 

Impala à face noire (Aepyceros melampus ssp. Petersi) par Copper via iNaturalist. Photo sous licence CC BY-NC 4.0.

Après avoir examiné une collection variée de 23 propositions, un jury d'experts a sélectionné six gagnants - deux pour la premiere place (remportant le prix de 10 000 euros chacun) et quatre pour la secondes places (remportant un prix de 3 500 euros chacun) - dans le cadre du Challenge GBIF Ebbe Nielsen 2018. Les solutions et les innovations conçues par les lauréats - et, évidemment, par tous les participants - reflètent et abordent des sujets d’intérêt et de préoccupation de grande envergure dans la communauté informatique de la biodiversité. Des sujets tels que les données ouvertes liées, la mobilisation de données, la qualité et l’interopérabilité des données.

 

Le Jury du Challenge Ebbe Nielsen 2018 fut constitué de :

  • Greg Riccardi, iDigBio
  • Jo Judge, Réseau national britannique sur la biodiversité
  • Marie Elise Lecoq, GBIF France
  • Eduardo Dalcin, Institut de recherche sur le jardin botanique de Rio de Janeiro
  • Dag Endresen, GBIF Norvège
  • Ana C.M. Malhado, Université fédérale d'Alagoas
  • Anabela Plos, GBIF Argentine | Muséem argentin des sciences naturelles
  • Anders G. Finstad, Université norvégienne des sciences et technologies
  • Philippe Grandcolas, Muséum national d’histoire naturelle

 

 

Le Challenge est un prix d'encouragement annuel qui honore la mémoire du Dr Ebbe Schmidt Nielsen, un leader inspirant dans les domaines de la biosystématique & de l'informatique de la biodiversité et l'un des principaux fondateurs du GBIF.

 

Le fait que l'édition 2018 du Challenge soit plus ouverte que les années précédente a réussi à susciter un engagement géographique plus large, les 23 participation du Challenge ayant recruté des participants de deux douzaines de pays. Les six équipes gagnantes représentent huit pays, dont deux - le Sri Lanka et la Lituanie - qui ne sont pas encore membres officiels du GBIF. La liste complète des gagnants, par ordre alphabétique, est la suivante :

 

 

1ère place

Checklist recipe : a template for reproducible standardization of species checklist data

Lien Reyserhove, Damiano Oldoni et Peter Desmet, INBO: Institut de recherche sur la nature et la forêt, Belgique

 

Ozymandias : a biodiversity knowledge graph

Roderic D. M. Page, Université de Glasgow, Royaume-Uni

 

2ème place

The bdverse

Tomer Gueta et Yohay Carmel, Technion - Institut israélien de technologie, Israël

Vijay Barve, Muséem d'histoire naturelle de la Floride, États-Unis

Thiloshon Nagarajah, Institut de technologie de l'informatique, Sri Lanka

Povilas Gibas, Université de Vilnius, Lituanie

Ashwin Agrawal, Institut indien de technologie (BHU), Inde

 

GBIF Issues Explorer

Luis J. Villanueva, Smithsonian Institution, États-Unis

 

Smart mosquito trap to DwC pipeline

Connor Howington et Samuel Rund, VectorBase.org, États-Unis

 

Taxonomy Tree Editor

Ashish Singh Tomar, Université de Grenade, Espagne | BIG4

 

Plus d’information (en anglais) ici

Les gouvernements du Cameroun et du Libéria ont rejoint le GBIF par le biais de la signature du Memorandum of Understanding (MoU), respectivement en tant que participant associé et participant votant.

 

Les institutions des deux pays ont dirigé des projets sur la mobilisation des données et la création de réseaux nationaux d’information sur la biodiversité dans le cadre du programme Biodiversity Information for Development, financé par l’Union européenne.

 

Cette initiative a contribué à intégrer plusieurs nouveaux pays et organisations dans le réseau GBIF en tant que participants officiels, ainsi que des dizaines d’autres en tant qu’institutions de publication de données. Ces pays se trouve dans les régions cibles "ACP" de BID en Afrique subsaharienne, dans les Caraïbes et dans le Pacifique.

 

Avec l’ajout du Cameroun et du Libéria, 20 pays africains participent maintenant officiellement au réseau intergouvernemental du GBIF. Cela fait de l’Afrique la deuxième plus grande région en termes d’adhésion, juste derrière les 21 participants nationaux de la région européenne. Plusieurs autres pays africains discutent actuellement de leur future participation ou non au GBIF.

 

Au Cameroun, le Memorandum of Understanding  a été signé par le ministre de l'Environnement, de la Protection de la nature et du Développement durable, Pierre Hélé. Les institutions basées dans le pays participent à quatre projets financés par le programme BID:

 

 

 

Au Libéria, le Memorandum of Understanding a été signé par le directeur général de l'Autorité du Développement Forestier, Mike Doryen. La décision de rejoindre le GBIF en tant que participant votant (les membres nationaux apportant une contribution financière indexée sur le PIB) a été prise dans le cadre d’un petit don du BID. Ce don porte sur le renforcement des capacités de mobilisation et de conservation des données sur la biodiversité au Libéria, dirigé par l’Université du Libéria en collaboration avec l'Autorité du Développement Forestier, Flore et faune du Libéria, et l’Université du Kansas (États-Unis).

 

Plus d’information (en anglais) ici

 

Scinque de feu (Lepidothyris fernandi), Buea, Cameroun. L'aire de répartition de ce lézard tropical s'étend à l'ouest et à l'ouest de l'Afrique centrale, y compris au Libéria et au Cameroun. Photo de Lennart Hud via les observations iNaturalist de recherche, sous licence CC BY-NC 4.0.

Les gagnantes des Young Researchers Awards 2018 décernés par le GBIF ont été dévoilées : il s'agit de Kate Ingenloff, doctorante à l'Institut de la biodiversité de l'Université du Kansas et de Raquel Gaião Silva, masteure en biodiversité marine à l'Université de Algarve, 1ère personne du Portugal a recevoir ce prix.

Les recherches de Kate Ingenloff combinent des enregistrements d'occurrences du réseau GBIF avec des données environnementales et comportementales spécifiques au temps. Ceci afin d'améliorer l'exactitude biologique et prédictive des modèles pour les espèces migratrices et autres espèces hautement mobiles utilisées dans la recherche, la conservation et les politiques.

Les recherches de Raquel Gaião Silva visent à utiliser les enregistrements d'occurrences du réseau GBIF et d'autres sources pour déterminer si et comment l'augmentation de la température des océans pourrait modifier la distribution des macroalgues le long des côtes atlantiques de l'Espagne et du Portugal.

Plus d'informations sur les travaux de Kate Ingenloff et Raquel Gaião Silva sont disponibles en ligne (en anglais).

 

Kate Ingenloff et Raquel Gaião Silva © Photos provenant du site GBIF.org

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