Samedi 17 Août 2019

GBIF

En ce début d'année 2019, plus de 25 Data Papers dont au moins un des auteurs est affilié à une institution française sont disponibles sur notre site.

Le dernier en date est une description de la base de données consacrée aux Asteroidea des régions Antarctique et sub-Antarctique, publié en 2018 par une équipe internationale (Belgique, France, Italie, Nouvelle-Zélande, Pologne, Royaume-Uni, USA) ; le jeu de données décrit est accessible sur l'IPT (Integrated Publishing Toolkit) de l'organisation ANTABIF.

Le Data Paper est une publication scientifique dont le but principal est de décrire un jeu de données ou un ensemble de jeux de données, plutôt que de rendre compte de résultats de recherche.

L’objectif est de créditer et de valoriser les efforts réalisés par les scientifiques et les institutions qui rendent accessibles leurs données à la communauté scientifique. 

Une fonction supplémentaire intégrée depuis la version 2.0.2 de l’outil de publication du GBIF génère automatiquement un manuscrit à partir des métadonnées donnant les informations clés sur un jeu de données accessible via le GBIF.org.

Ce manuscrit peut alors être soumis pour publication éventuelle dans l’une des publications Pensoft (Biodiversity data Journal, ZooKeys, PhytoKeys, BioRisks, NeoBiota), après examen par les pairs, ou dans d'autres publications scientifiques telles que Nature Conservation.

 

Crédit photo : biodiversity.aq

L'unité PatriNat recherche un ingénieur bio-informatique GBIF-INPN-SIB pour Mars 2019.

 

Offre d'emploi accessible ici

 

Le poste est un contrat de droit public (durée déterminée) à temps plein de 1 an (avec possibilité de renouvellement).

 

Le  dossier  de  candidature  est  à  envoyer  avant  le  10/01/2019 à :

recru-patrinat@mnhn.fr avec la mention : « GBIF-INPN-SIB ».

 

Ce dossier comprendra :

  • un curriculum vitae détaillé et tous les travaux susceptibles  d'éclairer le jury ;
  • une lettre de motivation.

 

Personnes à contacter pour toutes questions :

Mathieu Clair : chef de l’équipe « Application informatiques » - clair@mnhn.fr
Anne-Sophie Archambeau : Responsable GBIF France - archambeau@gbif.fr

 

EDIT :

 

L'offre d'emploi a été réouverte , vous trouverez toutes les informations ici.

 

Le  dossier  de  candidature  est  à  envoyer  avant  le  01/03/2019 à :

recru-patrinat@mnhn.fr avec la mention : « GBIF-INPN-SIB ».

Le quatrième appel dans le cadre du programme du Fonds d’information sur la biodiversité pour l’Asie (BIFA) appelle des projets qui :

  • Améliore la connaissance de la biodiversité asiatique grâce à l'accès aux données des collections biologiques et aux programmes de surveillance dans la région
  • Font participer la recherche et les communautés politiques à l'utilisation et à l'application des données mobilisées par le biais du GBIF

Le GBIF invite à soumettre des propositions dans le cadre de la quatrième phase du programme du Fonds d’information sur la biodiversité pour l’Asie (BIFA), financé par le ministère de l’Environnement du gouvernement du Japon.

 

Cet appel à propositions vise à relever les principaux défis que les nœuds du GBIF en Asie ont identifiés dans le cadre de la mobilisation et de l’utilisation des données sur la biodiversité dans la région. Le financement potentiel total affecté à cet appel est d’environ 71 000 € et les candidats peuvent demander un maximum de 15 000 € par l’intermédiaire de BIFA pour chaque projet.

 

L'appel à propositions comprend trois types de subventions :

 

Ces subventions sont ouvertes à toutes les institutions basées dans les pays asiatiques éligibles.

 

Les notes succinctes de présentation doivent être soumises au Secrétariat du GBIF avant le 6 janvier 2019, à l'aide du modèle approprié. Pour plus d'informations, contactez bifa@gbif.org.

 

Processus de candidature et calendrier

Un comité de sélection réuni par le secrétariat du GBIF évaluera les candidatures selon un processus en deux étapes.

  • Les notes conceptuelles initiales, à l'aide du modèle fourni, doivent être soumises au plus tard le 06 janvier 2019.
  • Les candidats sélectionnés seront invités à soumettre des propositions complètes en février 2019.
  • Après un examen final et une sélection, les projets financés devraient commencer en mai 2019. La période de mise en œuvre du projet sera d'environ mai 2019 à mars 2020.

 

Les candidats (quelque soit le type de subventions demandées) devront envoyer un membre de l'équipe de projet à un atelier de renforcement des capacités et obtenir une certification pour les compétences acquises. Cet atelier aura lieu en juin ou juillet 2019 et le coût de la participation sera pris en charge séparément des fonds du BIFA (les candidats ne doivent PAS l'inclure dans le budget du projet).

 

Plus de détails ici

 

Polype de bouton vert (Palythoa mutuki) de Gaurav Patil via iNaturalist. Photo sous licence CC BY-NC 4.0.

Le secrétariat du GBIF recherche un entrepreneur pour développer une application frontale basée sur React. Cette application multilingue basée sur des formulaires offrira aux éditeurs du monde entier la possibilité de gérer du contenu accessible via GBIF.org.

 

Compétences demandées :

  • Expérience de React JS et de l'environnement de construction SPA associé
  • Aisance avec les API RESTful
  • Connaissance des mécanismes d'autorisation modernes, tels que JSON Web Token
  • Connaissance des bibliothèques frontales Material UI ou Ant Design
  • Aisance avec la construction de SPA traduisibles
  • Connaissance des frameworks de test pour la validation des entrées de formulaire
  • Maîtrise de GitHub

 

Contexte

Dans le cadre de son infrastructure principale, le GBIF gère une base de données d'entités : organisations, personnes et jeux de données, toutes consultables via une interface RESTful (JSON) authentifiée. Aujourd'hui, une console Web basée sur AngularJS offre aux éditeurs internes la possibilité de gérer le contenu.

 

Les récentes extensions de l'API avec de nouveaux types de contenu, le désir d'ouvrir l'accès à l'édition aux utilisateurs externes et la nécessité de traiter une pile logicielle vieillissante ont amenés le secrétariat à rechercher une nouvelle solution. Le GBIF a développé une preuve de concept basée sur React et recherche un fournisseur pour les aider à mettre ce concept en production.

 

Les détails de la spécification du projet sont disponible ici

 

Approche

Le secrétariat prévoit une première session de contrôle sur site dans leur locaux, à Copenhague pour présenter le système existant et les exigences des fonctionnalités recherchées. Les travaux ultérieurs peuvent être entrepris à distance, en utilisant GitHub comme base de collaboration et avec des visites sur site uniquement si nécessaire.

 

Tout le code sera chargé dans le référentiel GitHub GBIF et publié sous une licence open source Apache 2.0.

 

Le GBIF souhaite la bienvenue aux manifestations d’intérêt pour entreprendre ce travail le plus tôt possible. Si vous êtes intéressé, veuillez envoyer un e-mail à Tim Robertson, responsable informatique du GBIF, avec:

  • Deux exemples ou plus montrant votre travail basé sur React
  • Une indication de votre taux journalier ou de votre préférence escompté (à discuter) lors d'une livraison à prix fixe
  • des informations sur votre disponibilité

 

Cet appel restera ouvert jusqu'à la nomination d'un contractant.

 

Plus d'information (en anglais) ici

 

Poulpe commun (Octopus vulgaris), au large de la côte sud-ouest de Bonaire. Photo 2018 de Dan Bender via des observations iNaturalist de recherche, autorisées sous CC BY-NC-SA 4.0.

Le secrétariat du GBIF, situé à Copenhague, recherche un développeur de logiciels pour travailler dans une petite équipe responsable du portail GBIF.org. Ce rôle se concentrera sur les services principaux et sur tous les aspects liés à l’API GBIF et aux services de données. Le poste est un poste à temps plein situé à Copenhague pour une période de 3 ans.

 

Compétences requises et expérience

  • Compétences de développement en Java 8 (ou autres langages JVM) ; modèles de conception logicielle, environnement multithread, gestion de la JVM et de la mémoire, structures de données et collections
  • Connaissance des banques de données; bases de données relationnelles (SQL)
  • Solide connaissance des services RESTful utilisant les formats XML et JSON
  • Compétences professionnelles en matière d'ingénierie logicielle: gestion des versions (versions maven, code de version forte), refactoring, normes de codage, intégration continue, tests d'unité / d'intégration, déploiement de logiciel et documentation
  • Maîtrise de l'utilisation du système d'exploitation Linux
  • Capacité à travailler dans un environnement anglophone
  • Compétences professionnelles pour donner et recevoir des commentaires sur le code
  • La capacité de travailler de manière autonome et en équipe

 

Compétences souhaitées

  • Les cadres Java Microservice; exemple: Dropwizard, Spring Boot, Vert.x,
  • Expérience en automatisation (Jenkins, Ansible, Chef, Marionnette, etc.)
  • Moteurs de recherche (Solr Cloud, Elasticsearch).
  • Expérience avec des solutions de surveillance (Nagios, Ganglia, Zabbix, Cactus, Graphite, ELK, etc.)
  • Connaissance de l'écosystème Hadoop (HDFS, Solr, HBase, Spark, Beam, Zookeeper)
  • Expérience de travail et de contribution à des projets open source

Avantages à travailler au GBIF

  • Une bonne ambiance d'équipe et un environnement de travail dynamique
  • L'opportunité d'apprendre et d'utiliser les technologies Big Data de pointe de l'écosystème Hadoop (HBase, Hive, Oozie, Solr Cloud, Spark, Beam)
  • La possibilité de travailler publiquement sur des projets open source, avec une implication directe dans la communauté des utilisateurs
  • Un package de rémunération compétitif
  • Un ordinateur portable puissant (Apple ou similaire) pour le développement
  • Plus important encore, le GBIF offre la possibilité de contribuer de manière significative à un effort international visant à créer et à gérer la plateforme Web mondiale pour les données ouvertes sur la biodiversité.

 

Il s’agit d’une opportunité passionnante pour les personnes concernées de développer leur expérience pour une organisation internationale dans un environnement scientifique et technologique en informatique de la biodiversité pour le développement durable. Si vous répondez à ces exigences et êtes en mesure de commencer dès que possible, nous espérons avoir de vos nouvelles.

 

Rémunération

Les salaires du GBIF sont compétitifs et sont exonérés de l'impôt sur le revenu danois. Le candidat sélectionné devrait vivre au Danemark et un programme de réinstallation est disponible pour le personnel recruté sur le plan international.

 

Procédure de candidature et délai

Les candidatures au poste doivent inclure une lettre mentionnant votre expérience et vos qualifications pour le poste, votre curriculum vitae et votre nom d'utilisateur GitHub. Elles doivent être soumises en anglais par courrier électronique à dev-job1-2018@gbif.org avant le 15 décembre 2018. Veuillez indiquer dans l'application où vous avez vu cette annonce. Les demandes concernant le poste peuvent être adressées à Federico Mendez, développeur logiciel principal, à fmendez@gbif.org, ou à la responsable des ressources humaines, Susanne Sheldon, à slsheldon@gbif.org.

 

Les entretiens pour le poste devraient avoir lieu à partir du début janvier 2019.

 

Offre d'emploi en version PDF

 

Plus d'informations ici

 

Impala à face noire (Aepyceros melampus ssp. Petersi) par Copper via iNaturalist. Photo sous licence CC BY-NC 4.0.

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