Dimanche 18 Novembre 2018

Challenge

Après avoir examiné une collection variée de 23 propositions, un jury d'experts a sélectionné six gagnants - deux pour la premiere place (remportant le prix de 10 000 euros chacun) et quatre pour la secondes places (remportant un prix de 3 500 euros chacun) - dans le cadre du Challenge GBIF Ebbe Nielsen 2018. Les solutions et les innovations conçues par les lauréats - et, évidemment, par tous les participants - reflètent et abordent des sujets d’intérêt et de préoccupation de grande envergure dans la communauté informatique de la biodiversité. Des sujets tels que les données ouvertes liées, la mobilisation de données, la qualité et l’interopérabilité des données.

 

Le Jury du Challenge Ebbe Nielsen 2018 fut constitué de :

  • Greg Riccardi, iDigBio
  • Jo Judge, Réseau national britannique sur la biodiversité
  • Marie Elise Lecoq, GBIF France
  • Eduardo Dalcin, Institut de recherche sur le jardin botanique de Rio de Janeiro
  • Dag Endresen, GBIF Norvège
  • Ana C.M. Malhado, Université fédérale d'Alagoas
  • Anabela Plos, GBIF Argentine | Muséem argentin des sciences naturelles
  • Anders G. Finstad, Université norvégienne des sciences et technologies
  • Philippe Grandcolas, Muséum national d’histoire naturelle

 

 

Le Challenge est un prix d'encouragement annuel qui honore la mémoire du Dr Ebbe Schmidt Nielsen, un leader inspirant dans les domaines de la biosystématique & de l'informatique de la biodiversité et l'un des principaux fondateurs du GBIF.

 

Le fait que l'édition 2018 du Challenge soit plus ouverte que les années précédente a réussi à susciter un engagement géographique plus large, les 23 participation du Challenge ayant recruté des participants de deux douzaines de pays. Les six équipes gagnantes représentent huit pays, dont deux - le Sri Lanka et la Lituanie - qui ne sont pas encore membres officiels du GBIF. La liste complète des gagnants, par ordre alphabétique, est la suivante :

 

 

1ère place

Checklist recipe : a template for reproducible standardization of species checklist data

Lien Reyserhove, Damiano Oldoni et Peter Desmet, INBO: Institut de recherche sur la nature et la forêt, Belgique

 

Ozymandias : a biodiversity knowledge graph

Roderic D. M. Page, Université de Glasgow, Royaume-Uni

 

2ème place

The bdverse

Tomer Gueta et Yohay Carmel, Technion - Institut israélien de technologie, Israël

Vijay Barve, Muséem d'histoire naturelle de la Floride, États-Unis

Thiloshon Nagarajah, Institut de technologie de l'informatique, Sri Lanka

Povilas Gibas, Université de Vilnius, Lituanie

Ashwin Agrawal, Institut indien de technologie (BHU), Inde

 

GBIF Issues Explorer

Luis J. Villanueva, Smithsonian Institution, États-Unis

 

Smart mosquito trap to DwC pipeline

Connor Howington et Samuel Rund, VectorBase.org, États-Unis

 

Taxonomy Tree Editor

Ashish Singh Tomar, Université de Grenade, Espagne | BIG4

 

Plus d’information (en anglais) ici

Challenge GBIF Ebbe Nielsen 2018

Êtes-vous un champion des données ouvertes ?

 
Le Challenge Ebbe Nielsen est un concours annuel visant à inciter les utilisations novatrices et l’ajout d’applications liées à l'infrastructure ouverte de recherche sur la biodiversité soutenue par le GBIF, le Système mondial d'information sur la biodiversité.
 
Ces applications innovantes des données issues du GBIF peuvent prendre diverses formes et formats, par exemple : nouvelles recherches analytiques, représentations visuelles plus complètes pour les prises de décision politiques, applications Web et mobiles, améliorations des processus de numérisation qualité et accessibilité des données, et bien plus encore.
 
Le Challenge 2018 récompensera des avancées dans le domaine de la science ouverte, concernant des outils et des techniques qui améliorent l'accès, l'utilité ou la qualité des données issues du GBIF. La récompense s’élèvera à 34 000€.
Dans le cadre de cet appel ouvert, les soumissions peuvent s'appuyer sur des outils et fonctionnalités existants, tels que les API GBIF, l’IPT (Integrated Publishing Toolkit), le validateur de données, l’outil d’occurrences d'espèces relatives ou développer de nouvelles applications, méthodes, workflows ou analyses.
 
Les propositions gagnantes étendront et augmenteront l'utilité, l'ouverture et la visibilité des données issues du GBIF pour les groupes d'acteurs identifiés. Chaque soumission devra démontrer les avantages qu’elle apporte pour au moins trois des groupes suivants: chercheurs, décideurs, éducateurs, étudiants et sciences participatives.
 
Les gagnants seront annoncés lors de la 25ème réunion du Conseil d'administration du GBIF, à Kilkenny, en Irlande, en octobre 2018.
 

Pré-requis 

 
Les participants doivent s'assurer que leurs soumissions sont facilement accessibles via Internet pour les membres du jury du Challenge et le personnel du Secrétariat du GBIF. 
Si cette condition est remplie, les participants sont invités à documenter et présenter leurs propositions via l’un des référentiels ou site web suivant : GitHub, Dryad, FigShare, Open Science Framework, Jupyter Notebook, etc.
Quel que soit le format, les participants doivent également fournir des informations et métadonnées à propos des participations. Cela inclut le nom des participations, les membres de l'équipe contribuant au Challenge, la description, les instructions d'utilisation, les motivations de l'équipe et leur emplacement source.
 
En encourageant les participants à utiliser des outils avec lesquels ils sont à l'aise, nous espérons que toute personne qui soumettra sa présentation pourra se concentrer sur des questions essentielles (quoi, pourquoi, comment) plutôt que sur l'endroit où elle sera hébergée. Les questions essentielles étant : Qu’est ce qui constitue la soumission ? Pourquoi  est-elle importante pour la communauté du GBIF ou les communautés qu’elle est censée servir ? Comment fonctionne-t-elle ?
 

Que devrais-je soumettre ?

 
Les participations peuvent être des outils tels que des sites Web, des applications autonomes ou mobiles ou des résultats d'analyses. Elles peuvent également constituer des améliorations procédurales, notamment pour l'analyse ou la visualisation de données, les flux de données, le téléchargement ou les annotations. Si la soumission est le résultat d'une analyse, l'analyse doit être répétable, et inclure suffisamment de détails pour pouvoir effectuer sa répétition.
 
Les champs obligatoires dans le formulaire d'inscription doivent comporter :
 
Le nom de la soumission / le titre
Les noms et affiliations des membres de l'équipe
Un résumé avec une brève description en anglais d'environ 200 mots
Une documentation précise de la soumission
Une vidéo d'introduction, des captures d'écran et / ou autres éléments visuels qui illustrent ou décrivent la soumission
 
Les soumissions basées en grande partie ou entièrement sur des travaux déjà publiés ne sont pas considérées comme des participations admissibles.
 

Egibilité

 
Le Challenge est ouvert aux individus, aux équipes de particuliers, aux entreprises (et à leurs employés), ainsi qu'aux agences gouvernementales (et à leurs employés). Les personnes faisant partie d’une équipe doivent sélectionner un délégué qui représentera et agira au nom de l’équipe. Ce représentant servira de point de contact principal entre l'équipe et le GBIF pour assumer tous les droits et responsabilités concernant le Challenge. Si une participation provenant d’une équipe est sélectionnée comme gagnante, le GBIF versera l'intégralité du prix au représentant de celle-ci. A la charge du représentant de distribuer ensuite l'argent du prix aux autres membres de l'équipe.
 
Sont exclus du Challenge :
 
Les membres du Secrétariat du GBIF
Les particuliers actuellement sous contrat externe délivré par le Secrétariat du GBIF
Les membres du comité scientifique du GBIF
Les chefs de délégation au GBIF
 

Date limite pour les soumissions

 
Les personnes ou équipes intéressées peuvent soumettre leur(s) contribution(s) à partir du 9 mai 2018 via la page de soumission du challenge Ebbe Nielsen
 
Les inscriptions doivent être reçues au plus tard le mercredi 5 septembre 2018 à 16h00 (heure Paris)
 

Critères

 
Un jury composé d'experts des domaines scientifiques, informatiques et technologiques pertinents évaluera les soumissions en fonction des critères suivants:
 
Ouverture et réitération : les éléments constitutifs de la soumission, comme le code et le contenu, sont-ils librement disponibles et transparents ? Ont-ils les autorisations adéquates ?
Applicabilité : La soumission a-t-elle une pertinence et une portée suffisantes pour que les communautés du GBIF puissent l’utiliser ou la mettre en place ?
 Nouveauté : Une partie significative de la soumission a-t-elle été développée spécifiquement pour le challenge ? 
 

Contexte

 
Le Challenge Ebbe Nielsen honore la mémoire du Dr. Ebbe Schmidt Nielsen, un leader inspirant dans les domaines de la biosystématique et de l'informatique sur la biodiversité. Il fut l'un des principaux fondateurs du GBIF, et est mort tragiquement juste avant la naissance de celui-ci.
 

Sponsor

 
Le Challenge 2018 est financé en partie grâce au soutien du Conseil suédois de la recherche.
 
Plus d’information (en anglais) : ici
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